遊戲設定
當開始新遊戲時，需要進行一些遊戲設定來確定你的遊戲難度、發展方式等等。
遊戲模式
開始新遊戲時，玩家需要先選擇遊戲模式。遊戲模式共有兩種：「生存」和「毫不費力」。它們實際上是兩種遊戲設定的預設，實際遊戲內容沒有區別。在選擇遊戲模式後，玩家仍然可以任意調節遊戲設定。
生存
做好準備，向這無情的世界邁出一步。任何失誤都可能導致你的殖民地崩盤。
「生存」模式是「標準」的遊戲模式。此遊戲模式下，各遊戲設定都設定為「預設」。如無特殊說明，本wiki上的資料均反映了這一模式下的資訊。
在「大開大合更新」前，遊戲本體和《眼冒金星》DLC 具有不同的遊戲機制。這導致在代碼合併後（「沁人心脾更新」）兩者的「生存」模式具有了不同的遊戲設定。具體而言，遊戲本體中的太空服損耗預設關閉，而《眼冒金星》中則為預設損耗速度。
毫不費力
當（遲早會降臨的）災難來臨時，深呼吸保持冷靜。你有足夠多的時間尋找解決方案。
「毫不費力」模式是比「生存」模式更簡單的遊戲模式。此遊戲模式調整了幾個遊戲設定：
- 疾病：病菌抗性
- 飢餓：節食
- 士氣：冷酷
- 耐久度：加固
- 流星雨：春意陣雨
輻射：健康光彩- 壓力：生氣勃勃
該模式下，遊戲機制並沒有根本改變，遊戲過程中的許多挑戰也不會因此消失。不過複製人們更加「堅韌」，因而容易生存下來，從而讓玩家有更多的時間來應對這些挑戰。
選擇目的地
選擇遊戲模式後，就進入了選擇目的地的階段。在這一階段，玩家可以選擇小行星（中為星群）、世界生成種子和遊戲設定。世界生成種子包含了小行星的類型、特質、地圖樣式和玩家選擇的遊戲設定。
遊戲設定
在這裡有幾個設定項可供玩家調節。若不做調整，則會使用遊戲模式預定義的參數。
檔位設定
有 6 個設定項可以選擇檔位：
- 疾病：影響複製人遭受病菌侵染後患病的機率
- 完全免疫：就像有外交豁免權一樣，但沒有外交。這些複製人從不生病（病菌抗性 +200）
- 病菌抗性：這些複製人因遭受病菌侵染而患病的機率降低（病菌抗性 +2）
- 預設：無加成
- 病菌敏感：這些複製人因遭受病菌侵染而患病的機率增高（病菌抗性 -1）
- 疫病之災：如果一名複製人拿打噴嚏開玩笑的話，整個殖民地都會遭受瘟疫的折磨（病菌抗性 -2）
- 飢餓：影響複製人燃燒卡路裡和飢餓的速率
- 無胃者：這些複製人列印出來就沒有胃，完全不需要食物（卡路裡額外 +infinity/週期）
- 節食：複製人燃燒卡路裡很慢，吃一點就能活下去（卡路裡額外 +500/週期）
- 預設 （無特質影響下為 -1000/週期）
- 無底胃：複製人燃燒卡路裡很快，需要比正常更多的食物（卡路裡額外 -500/週期）
- 飢腸轆轆：你的複製人在按規定飲食呢……就是看到什麼就吃什麼（卡路裡額外 -1000/週期）
- 士氣：調整複製人避免增加壓力必須維持的最低士氣
- 完全麻木：這些複製人沒有標準，無論士氣如何都不會增加壓力
- 冷酷：複製人需要比正常更低的士氣就可以抵禦壓力
- 預設
- 挑剔：複製人需要比正常更高的士氣才可以抵禦壓力
- 嚴格要求：精英中的精英也很難做到這些複製人的嚴格要求
- 耐久度：影響可裝備的太空服損耗速度
- 永不磨損：複製人精通服裝製造，能夠使太空服永久使用
- 加固：太空服比平常更耐用 （使用中的太空服耐久 -5%/週期）
- 預設 （使用中的太空服耐久 -10%/週期）
- 易損：太空服比平常損耗更快 （使用中的太空服耐久 -15%/週期）
- 破敗不堪：太空服比平常損耗更快 （使用中的太空服耐久 -20%/週期）
- 流星雨：調整來襲太空岩的強度
- 晴空萬裡：沒有流星損傷，不必擔心
- 春意陣雨：流星雨比平常更不頻繁，強度也更低
- 預設：預設的流星雨頻率和強度
- 宇宙風暴：流星雨比平常更頻繁，強度也更高
- 末日浩劫：一場世界末日般的「冰雹」襲擊，感覺就是針對你來的
- 壓力：影響複製人壓力上升的速度
- 極樂心境：強大的情感支持系統使得這些複製人不受壓力影響（壓力 -infinity/週期）
- 生氣勃勃：生氣勃勃（壓力 -10%/週期）
- 預設
- 悶悶不樂：複製人增加壓力比通常更快（壓力 +10%/週期）
- 失魂落魄：這些複製人從來沒被教過如何應對壓力……這會使他們被壓力打垮（壓力 +20%/週期）
在中，還有一個額外選項：
- 輻射：影響複製人對輻射病的易感程度
- 輻射抵抗：複製人可以籠罩在放射性廢物中，甚至都察覺不到
- 健康光彩：複製人比平常更能抵抗輻射暴露
- 預設
- 毒性敏感：複製人比平常對輻射暴露更敏感
- 臨界質量：僅僅是提一下輻射，複製人都會感到不適……並且可能永遠都無法完全康復
| 難度 | 輕微輻射病 | 嚴重輻射病 | 極端輻射病 | 致命輻射病 | 修正係數 |
|---|---|---|---|---|---|
| 臨界質量 | 33 | 100 | 200 | 300 | x0.33 |
| 毒性敏感 | 66 | 200 | 400 | 600 | x0.66 |
| 預設 | 100 | 300 | 600 | 900 | x1 |
| 健康光彩 | 200 | 600 | 1200 | 1800 | x2 |
| 輻射抵抗 | 10000 | 30000 | 60000 | 90000 | x100 |
勾選設定
有 5 個設定項提供勾選框，它們分別決定：
- 複製人是否會有壓力反應（預設為是）
- 列印艙是否會列印補給包裹（預設為是）
- 是否啟用沙盒模式（預設為否）
- 是否啟用快速工作者模式（預設為否）
- 遊戲存檔是否儲存到雲端（預設為是）
在中，還有一個額外選項：世界生成時是否生成供給傳送器（預設為是）
沙盒模式
在遊戲設定中可啟用沙盒模式。若開啟了沙盒模式，遊戲時左上角 UI 會顯示「沙盒模式」按鈕。玩家在遊戲時可以任意開閉沙盒模式。
開啟沙盒模式可以讓玩家幾乎無限制地遊玩：所有研究都被解鎖，所有建築都可以瞬間建造且不消耗資源，可以任意刪除、填充方塊，生成生物和物品，等等。若關閉沙盒模式，則研究會重置為沙盒模式開啟前的狀態，但對世界的變更會得到保留。
開啟沙盒模式的存檔不能獲得成就。
選擇複製人
設定完畢後，玩家需要選擇 3 名初始複製人以開始遊戲，並為殖民地命名。複製人可以任意刷新。
完成以上三步後，遊戲就正式開始了。